Ein detailliertes Verständnis der 3D-Struktur von Chromatin ist ein Schlüsselelement für die Untersuchung einer Vielzahl von Prozessen innerhalb der Zelle. Da direkte Methoden zur experimentellen Bestimmung dieser Strukturen nicht die gewünschte räumliche Genauigkeit aufweisen, haben computergestützte Inferenzmethoden auf der Grundlage von Einzelzell-Hi-C-Daten großes Interesse geweckt

In diesem Projekt entwickeln wir ein Simulationsprotokoll weiter, um die Auflösung der vorhergesagten Interphasen-Strukturen iterativ zu verbessern und Möglichkeiten zu erforschen, um auch Bulk-Daten zu berücksichtigen. Wir werden zudem Alternativen zu HiC wie mFISH oder GAM als Grundlage für unseren Modellierungsansatz untersuchen.

Programmierkenntnisse sind notwendig.